Расширение самостоятельности вузов – это важный этап развития образовательной системы государства. Естественным шагом последующего развития стало создание и укрепление саморегулирования высших учебных заведений. Последовательно осуществляются целенаправленные меры по трансформации ведущих вузов страны в автономные университеты по опыту и типу аналогичных научно-образовательных учреждений зарубежных стран.

В системе высшего образования внедрена трехуровневая модель подготовки кадров по программам бакалавриата, магистратуры и докторантуры PhD. Непрерывность процесса образования, обеспечивающего преемственность его уровней - один из основных принципов государственной образовательной политики Казахстана. Предусмотрена возможность, после успешного завершения программы первого цикла, получить доступ к программам второго цикла, а по завершении второго цикла к программе третьего цикла. Казахстан как полноправный член Европейского пространства высшего образования активно внедряет параметры Болонского процесса в систему высшего образования. Модернизация осуществляется с использованием компетентностной модели в образовательных программах; активным развитием мобильности студентов, увеличением роли информационных технологий, внедрением полиязычия и совершенствованием учебно-методической базы в соответствии с мировыми образовательными тенденциями.